Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr88Q9EPB7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms