Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc97Q9DBT3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc97Q9DBT3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms