Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med29Q9DB91 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med29Q9DB91 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms