Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp12Q9D9M2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Usp12Q9D9M2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Usp12Q9D9M2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Usp12Q9D9M2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp12Q9D9M2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Usp12Q9D9M2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp12Q9D9M2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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