Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arpc5lQ9D898 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms