Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pfn4Q9D6I3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms