Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspb11Q9D6H2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspb11Q9D6H2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms