Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrameQ9D4Z5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrameQ9D4Z5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms