Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D4W2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D4W2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9D4W2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms