Protein–RNA interactions for Protein: Q9D413

Sh2d6, SH2 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d6Q9D413 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh2d6Q9D413 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d6Q9D413 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms