Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700034E13RikQ9D2T6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700034E13RikQ9D2T6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms