Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nol3Q9D1X0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms