Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab3bQ9CZT8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab3bQ9CZT8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms