Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nip7Q9CXK8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nip7Q9CXK8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms