Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Cnih4Q9CX13 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Cnih4Q9CX13 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Cnih4Q9CX13 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Cnih4Q9CX13 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnih4Q9CX13 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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