Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX8

Mrps36, 28S ribosomal protein S36, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps36Q9CQX8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrps36Q9CQX8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrps36Q9CQX8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms