Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nuf2Q99P69 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nuf2Q99P69 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nuf2Q99P69 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nuf2Q99P69 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nuf2Q99P69 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nuf2Q99P69 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms