Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cep41Q99NF3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms