Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nkd1Q99MH6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nkd1Q99MH6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms