Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaja3Q99M87 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaja3Q99M87 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaja3Q99M87 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaja3Q99M87 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms