Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rwdd2bQ99M03 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms