Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms