Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn16Q925N4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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