Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SptssbQ925E8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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