Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tubb6Q922F4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb6Q922F4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms