Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms