Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cabp4Q8VHC5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms