Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhdc3Q8VEM9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhdc3Q8VEM9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms