Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8R2K8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8R2K8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8R2K8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8R2K8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms