Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Colec12Q8K4Q8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Colec12Q8K4Q8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms