Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx5Q8K1E0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx5Q8K1E0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms