Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33aQ8K0Y2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms