Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FgbQ8K0E8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FgbQ8K0E8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms