Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm28Q8CGC6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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