Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8C3W1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3W1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3W1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3W1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3W1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3W1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q8C3W1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q8C3W1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q8C3W1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms