Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube3dQ8BX13 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube3dQ8BX13 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms