Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrfn4Q80XU8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrfn4Q80XU8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms