Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ScocQ78YZ6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ScocQ78YZ6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ScocQ78YZ6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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