Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms