Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HjurpQ6PG16 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms