Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptpdc1Q6NZK8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpdc1Q6NZK8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms