Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms