Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ParpbpQ6IRT3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ParpbpQ6IRT3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms