Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp1Q62442 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp1Q62442 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms