Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf6Q62311 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf6Q62311 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms