Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itga7Q61738 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga7Q61738 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms