Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcanQ61361 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcanQ61361 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BcanQ61361 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BcanQ61361 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms