Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd3Q61060 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd3Q61060 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms