Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PtprnQ60673 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PtprnQ60673 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PtprnQ60673 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PtprnQ60673 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PtprnQ60673 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprnQ60673 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PtprnQ60673 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprnQ60673 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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