Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prdm1Q60636 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prdm1Q60636 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms